Prolín sa často nachádza na konci skrutkovice α alebo v zákrutách alebo slučkách. Na rozdiel od iných aminokyselín, ktoré existujú takmer výlučne v trans-forme v polypeptidoch, prolín môže existovať v cis-konfigurácii v peptidoch.
Obsahujú alfa helixy prolínové zvyšky?
Teraz, keď je v Proteínovej databanke viac ako 30 000 proteínových štruktúr, je jasné, že prolínové zvyšky sú prítomné v α-helixoch, kde často hrajú dôležitú úlohu v štruktúre a funkcii proteínu.
Aké aminokyseliny sú v alfa helixoch?
Ktorákoľvek z 20 aminokyselín sa môže podieľať na α-helixe, ale niektoré sú obľúbenejšie ako iné. Ala, Glu, Leu a Met sa najčastejšie nachádzajú v špirálach, zatiaľ čo Gly, Tyr, Ser a Pro sú menej pravdepodobné.
Obsahujú beta hárky prolín?
Prolín nie je uprednostňovaný v beta štruktúrach listov, pretože nemôže dokončiť H-väzbovú sieť. Keď sa prolín vyskytuje v listoch, môže to byť vydutina alebo okraj listu, kde nedostatok doneru amino vodíkovej väzby nie je kritický.
Čo obsahuje alfa helixy?
Alfa helix (α-helix) je bežným motívom v sekundárnej štruktúre proteínov a je to konformácia pravej helixy, v ktorej je každý hlavný reťazec N-H skupiny vodíkom väzby na kostru C=O. skupina aminokyseliny umiestnená o štyri zvyšky skôr pozdĺž proteínovej sekvencie.
