Pretože DdNTP majú molekulu vodíka (-H) namiesto hydroxylovej skupiny (-OH) pripojenú k 3'-C svojej deoxyribózy, nemôže sa viazať na žiadne prichádzajúce nukleotidy. Preto pridanie DdNTP počas replikácie DNA možno použiť na ukončenie syntéznej reakcie.
Prečo sa syntéza DNA zastaví, keď sa ddNTP začlení do rastúceho reťazca DNA?
Ak je pridaný nukleotid "dideoxynukleotid" (obrázok 6.29), 3' koniec rastúceho vlákna bude mať teraz H namiesto OH. Toto zabráni pridávaniu akýchkoľvek ďalších nukleotidov; t.j. in vitro syntéza DNA sa v tomto bode zastaví.
Ako ddNTP ukončí syntézu DNA?
Keď je ddNTP začlenený do reťazca nukleotidov, syntéza sa ukončí. Je to preto, že molekule ddNTP chýba 3' hydroxylová skupina, ktorá je potrebná na vytvorenie spojenia s ďalším nukleotidom v reťazci.
Prečo DdNTP ukončujú proces replikácie?
Laboratórne metódy v enzymológii: DNA
Dideoxynukleotid trifosfáty sa ľahko začleňujú do rastúceho reťazca DNA, ale chýba im 3′ hydroxylová skupina potrebná na pokračovanie reťazca, a účinne ukončiť polymerizáciu.
Prečo dideoxynukleotidy spôsobujú zastavenie replikácie DNA?
Týmto ddNTP chýba 3′-OH skupina, ktorá je potrebná na vytvorenie fosfodiesterovej väzby medzi dvomanukleotidy, čo spôsobí zastavenie predlžovania reťazca DNA, keď sa pridá ddNTP.