Polyadenylačný signál – sekvenčný motív rozpoznávaný komplexom štiepenia RNA – sa medzi skupinami eukaryotov líši. … Miesto štiepenia spojené s polyadenylačným signálom sa môže meniť až do 50 nukleotidov. Keď sa RNA štiepi, začne sa polyadenylácia katalyzovaná polyadenylát polymerázou.
Aký je účel polyadenylačného signálu?
Účel a mechanizmus polyadenylácie sa medzi typmi buniek líši, ale polyadenylácia vo všeobecnosti slúži na podporu dlhovekosti transkriptu v eukaryotoch a podporu degradácie transkriptu u prokaryotov.
Kde sa nachádza polyadenylačná signálna sekvencia?
Stepenie mRNA u cicavcov sa považuje za kontrolované dvoma signálmi dominantnej sekvencie, dobre definovaným polyadenylačným signálom (PAS) umiestneným 10–30 báz proti smeru od miesta štiepenia mRNA (CS)a menej konzervovaná sekvencia bohatá na U, nazývaná downstream sekvenčný prvok (DSE) a nachádza sa v rámci prvých 30 nukleotidov …
Kde sa polyadenylačná signálna sekvencia najčastejšie nachádza v géne?
V systéme cicavcov si účinná polyadenylácia vyžaduje dve hlavné sekvenčné zložky: vysoko konzervovaný signál AAUAAA umiestnený 10–30 nukleotid 5′ od miesta štiepenia a variabilnejší GU- bohatý prvok, 20–40 báz 3′ stránky (pozri recenzie Proudfoot 1991; Colgan a Manley 1997).
Čo je najbežnejšiekonsenzuálna sekvencia pre polyadenyláciu?
Takmer všetky eukaryotické polyadenylačné signály obsahujú centrálny upstream element, konsenzuálnu sekvenciu AAUAAA (alebo variant) ~10-35 nukleotidov upstream od skutočného miesta poly(A) adície(recenzované v 6-7, 12).
