BLAST možno použiť na niekoľko účelov. Patria sem identifikácia druhov, lokalizácia domén, stanovenie fylogenézy, mapovanie DNA a porovnanie. S použitím BLAST môžete správne identifikovať druh alebo nájsť homologické druhy.
Na čo sa BLAST používa?
BLAST je počítačový algoritmus, ktorý je k dispozícii na použitie online na webovej stránke Národného centra pre biotechnologické informácie (NCBI), ako aj na mnohých iných stránkach. BLAST dokáže rýchlo zarovnať a porovnať dopytovanú sekvenciu DNA s databázou sekvencií, čo z neho robí kritický nástroj v prebiehajúcom genomickom výskume.
Čo je technika BLAST?
Technika BLAST je metóda riešenia sťažností, ktorú vyvinul Albert Barneto . Mnemotechnická pomôcka znamená veriť, počúvať, ospravedlňovať sa, uspokojiť a poďakovať (tabuľka 1). 6. Tento článok popisuje jeho užitočnosť pri starostlivosti o pacienta a ako nástroj na klinickú výučbu.
Ako funguje BLAST DNA?
Ako funguje BLAST? BLAST identifikuje homológne sekvencie pomocou heuristickej metódy, ktorá na začiatku nájde krátke zhody medzi dvoma sekvenciami; teda metóda neberie do úvahy celý sekvenčný priestor. Po úvodnej zhode sa BLAST pokúsi spustiť lokálne zarovnania z týchto úvodných zhôd.
Prečo je BLAST rýchlejší ako Fasta?
Z hľadiska zložitosti algoritmu je BLAST rýchlejší ako FASTA vyhľadávaním iba dôležitejších vzorov vsekvencie. Citlivosť (alebo presnosť) BLAST a FASTA má tendenciu byť odlišná pre sekvencie nukleových kyselín a proteínov (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
