Arabinóza je päťuhlíkový cukor, ktorý sa bežne vyskytuje v prírode a môže slúžiť ako jediný zdroj uhlíka v mnohých baktériách. Proteínové produkty z troch génov (araB, araA a araD) sú potrebné na degradáciu arabinózy u členov čeľade Enterobacteriaceae, ako sú E. coli a S.
Čo robí arabinóza s baktériami?
Keď je teda prítomná arabinóza na zapnutie arabinózového operónu, produkuje sa GFP a baktérie môžu fluoreskovať. Bez arabinózy nie je gén GFP exprimovaný a neexistuje žiadna fluorescencia. Takže zmenou zloženia živín môže výskumník kontrolovať, kedy (a či) sa v transformovaných baktériách vyskytne florescencia.
Aká je úloha arabinózy pri transformácii baktérií?
Arabinóza pôsobí ako alosterický regulátor AraC, ktorý mení, na ktoré miesta DNA sa viaže a ako tvorí dimér. Pamätajte, že arabinóza je cukor, ktorý sa katabolizuje proteínmi operónu AraBAD. Keď sa arabinóza pridá do prostredia, v ktorom E. coli žije, pevne sa naviaže na AraC.
Prečo sa používa arabinóza?
Použitie v biológii
V syntetickej biológii sa arabinóza často používa ako jednosmerný alebo reverzibilný prepínač na expresiu proteínov pod Pbadpromótor v E. coli. Toto zapnutie môže byť negované prítomnosťou glukózy alebo zvrátené pridaním glukózy do kultivačného média, čo je forma katabolitovej represie.
Akoovplyvňuje arabinóza génovú reguláciu a expresiu v baktériách?
Keď je prítomná arabinóza, araC uvoľňuje konfiguráciu DNA, takže môže dôjsť k transkripcii, ale keď tento sacharid chýba, rovnaký proteín obmedzuje DNA, aby sa znížila jej schopnosť viazať sa s RNA polymerázou.
