Peptidové väzby majú rovinnú, trans, konfiguráciu a podliehajú veľmi málo rotácii alebo krúteniu okolo amidovej väzby, ktorá spája α-amino dusík jednej aminokyseliny s karbonylovým uhlíkom nasledujúceho (obrázok 4-1).
Prečo je rotácia okolo peptidovej väzby zakázaná?
Prečo je rotácia okolo peptidovej väzby zakázaná a aké sú dôsledky absencie rotácie? Peptidová väzba má charakter čiastočnej dvojitej väzby, ktorý zabraňuje rotácii. Tento nedostatok rotácie obmedzuje konformácie peptidovej kostry a obmedzuje možné štruktúry.
Môžu sa peptidové väzby ohýbať?
Keďže kostra polypeptidu, držaná pohromade peptidovými väzbami, je flexibilná (kvôli „rotácii okolo všetkých týchto väzieb“), reťaz sa môže ohýbať, krútiť, a ohýbať sa do veľkého množstva trojrozmerných tvarov.
Sú peptidové väzby reverzibilné?
Hoci tvorba peptidovej väzby môže byť zvrátená pridaním vody (hydrolýza), amidové väzby sú veľmi stabilné vo vode pri neutrálnom pH a hydrolýza peptidových väzieb v bunkách je tiež enzymaticky kontrolovaný.
Majú peptidové väzby smerovosť?
Aj keď je geometria peptidovej skupiny pevná, väzby na oboch stranách alfa uhlíkov sa môžu otáčať. To umožňuje flexibilitu v peptidovej kostre. … poradie aminokyselín v proteíne má smerovosť aleboorientácia, ktorá je definovaná funkčnými skupinami na koncoch reťazca.
