V molekulárnej biológii je STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) biologická databáza a webový zdroj známych a predpovedaných interakcií proteín-proteín. … Najnovšia verzia 11b obsahuje informácie o približne 24,5 miliónoch bielkovín z viac ako 5000 organizmov.
Aký je účel databázy STRING?
Cieľom databázy STRING je zhromaždiť a integrovať tieto informácie konsolidáciou známych a predpovedaných proteínových–údajov o asociácii proteínov pre veľký počet organizmov.
Čo je skóre STRING?
V STRING je každá interakcia proteín-proteín označená jedným alebo viacerými „skóre“. Dôležité je, že tieto skóre neindikujú silu alebo špecifickosť interakcie. Namiesto toho sú ukazovateľmi dôvery, t.j. s akou pravdepodobnosťou STRING považuje interakciu za pravdivú, vzhľadom na dostupné dôkazy.
Prečo bielkoviny interagujú?
Proteín-proteínové interakcie (PPI) sú fyzikálne kontakty s vysokou špecifickosťou vytvorené medzi dvoma alebo viacerými proteínovými molekulami ako výsledok biochemických dejov riadených interakciami, ktoré zahŕňajú elektrostatické sily, vodík lepenie a hydrofóbny efekt.
Čo je funkčné spojenie?
definícia. Binárny vzťah medzi biologickými entitami keď jedna z nich moduluje druhú z hľadiska funkcie, expresie, degradácie alebo stability druhej a vzťahumedzi partnermi nemožno určiť ako priame, takže medzikroky sú implicitne prítomné.