Naproti tomu väčšina eukaryotických DNA ligáz spolu s archaálnymi a bakteriofágovými enzýmami spadá do druhej podrodiny; tieto enzýmy využívajú ATP ako kofaktor.
Vyžadujú ligázy ATP?
Bežne sa používajú dve DNA ligázy. … T4 ligáza vyžaduje ATP , zatiaľ čo ligáza E. coli vyžaduje NAD+ (nikotínamid adeníndinukleotid je koenzým, ktorý pozostáva z 2 nt spojených prostredníctvom ich fosfátových skupín). Obidve katalyzujú spojenie 5′-fosfátovej a 3′-OH skupiny za vzniku fosfodiesterovej väzby.
Prečo ligázy potrebujú ATP?
Dva kroky DNA ligačnej reakcie
Samotná DNA ligačná reakcia má dva základné kroky. Po prvé konce DNA sa musia náhodne zraziť a zostať spolu dostatočne dlho na to, aby sa k nim ligáza spojila. … Aby mohol enzým vykonávať ďalšie reakcie, musí byť AMP v aktívnom mieste enzýmu doplnený ATP.
Akú funkciu majú ligázy?
DNA ligázy hrajú zásadnú úlohu pri udržiavaní genómovej integrity tým, že spájajú zlomy vo fosfodiesterovej kostre DNA, ku ktorým dochádza počas replikácie a rekombinácie a ako dôsledok poškodenia DNA a jej oprava. Tri ľudské gény, LIG1, LIG3 a LIG4 kódujú ATP-dependentné DNA ligázy.
Čo sú to ligázy, fungujú aktívne alebo pasívne?
DNA ligáza je aktívna počas replikácie, procesu opravy a rekombinácie DNA. Je široko používaný pri opravách jednovláknovýchzlomy v duplexnej DNA živých organizmov pomocou komplementárneho vlákna dvojitej špirály ako templátu, zatiaľ čo niektoré formy môžu špecificky napraviť poškodenie dvojvlákna.
