Agarózové gély sa používajú s DNA kvôli väčšej veľkosti biomolekúl (fragmenty DNA majú často tisíce kDa). V prípade proteínových gélov poskytuje polyakrylamid dobré rozlíšenie, pretože oveľa menšia veľkosť (typická je 50 kDa) je vhodnejšia pre užšie medzimolekulové medzery v géli.
Aký je rozdiel medzi elektroforézou na agarózovom géli a elektroforézou na polyakrylamidovom géli?
Hlavný rozdiel medzi agarózou a polyakrylamidom je v tom, že agaróza sa používa v elektroforéze na agarózovom géli (AGE) hlavne na separáciu DNA, zatiaľ čo polyakrylamid sa používa v polyakrylamidovom géli elektroforéza (PAGE) hlavne na separáciu proteínov.
Prečo sú polyakrylamidové gély lepšie ako agarózový gél?
Polyakrylamidové gély majú oproti agarózovým gélom tieto tri hlavné výhody: (1) Ich rozlišovacia schopnosť je taká veľká, že dokážu oddeliť molekuly DNA, ktorých dĺžka sa líši len o 0,1 % (t.j. 1 bp na 1000 bp). (2) Dokážu pojať oveľa väčšie množstvá DNA ako agarózové gély.
Prečo sa pri charakterizácii bielkovín používa namiesto agarózy polyakrylamid?
Polyakrylamid a agaróza sú dve podporné matrice bežne používané v elektroforéze. … Agaróza má veľkú veľkosť pórov a je vhodná na separáciu nukleových kyselín a veľkých proteínových komplexov. Polyakrylamid má menšiu veľkosť pórov a je ideálny preoddeľuje väčšinu bielkovín a menšie nukleové kyseliny.
Prečo sa používa polyakrylamidový gél?
Polyakrylamidová gélová elektroforéza (PAGE) sa bežne používa na analýzu proteínov a možno ju použiť aj na separáciu fragmentov nukleových kyselín menších ako 100 bp. Nukleové kyseliny sa zvyčajne analyzujú pomocou kontinuálneho pufrovacieho systému, kde je v géli konštantné zloženie pufra, pH a veľkosť pórov.
